全身：发热、疲倦、乏力、体重减轻等。

皮肤、黏膜：蝶形红斑是最具特征性的皮肤改变；还有广泛或局限性斑丘疹，多见于日晒部位；也可为其他皮疹，如盘状红斑、指掌部和甲周红斑、指端缺血、面部及躯干皮疹等。

关节、肌肉：对称性多关节肿痛，常见于指、腕、膝关节，可出现肌痛和肌无力。

肾脏：狼疮性肾炎是本病最常见和严重的临床表现。几乎所有患者在病程中均有肾脏受累，45%~85%的患者出现蛋白尿、血尿、管型尿、水肿及血压升高等临床表现，晚期可发展为尿毒症，是常见的死亡原因。

心脏：可累及心脏各个部位，其中心包炎最常见，严重者可发生心力衰竭。

肺与胸膜：50%以上的患者在急性发作期出现单侧或双侧胸膜炎或中小量的胸腔积液；约10%的患者发生狼疮性肺炎，出现发热、干咳、气促等表现。

其他：除此之外，还会累及神经系统、消化系统及血液系统等，也可引起血栓形成、习惯性自发性流产及继发性干燥综合征等。